Село Собакино, в которое входили деревни Хлебниково и Капустино, располагалось вдоль Большой Дмитровской дороги по обеим сторонам. Река Клязьма протекала через Хлебниково и пересекала Дмитровский тракт практически под прямым углом. Через реку был проложен мост. В Хлебникове дорога уклонялась на запад, после чего за деревней, вновь уходила в северо-восточном направлении. Вокруг деревни лежали пахотные земли, пересеченные оврагами и ручьями, стекавшими в Клязьму. Один из таких ручьев пересекал деревенскую улицу, два других - огибали ее.

Документальные упоминания о Хлебниково старше, чем упоминания о любом другом поселении на территории г. Долгопрудного, и относятся к XV веку, когда Хлебниково принадлежало Я.К. Козодавлю. В 1498 г. он променял его Великому князю, от которого эта земля перешла к Траханиотову. Село Собакино на реке Клязьме упоминается в документах ХVI века в числе дворцовых вотчин. Видимо, это село в какое-то время принадлежало Г.С. Собакину, как и раскинувшееся неподалеку Чашниково, и названо по фамилии его владельца.

Документальные упоминания о Хлебниково относятся к XV веку, когда оно принадлежало Я. К. Козодавлю. В 1498 г. он променял его Великому князю, от которого эта земля перешла к Траханиотову. В 1623 г. земли принадлежали князю Юрию Яншеевичу Сулешову, затем Хлебниково на Клязьме и Капустино на реке Созонье были переданы его внуку Ивану Мурзину, сыну Юсупова. Впоследствии хозяином стал князь Яков Кудепетович Черкасский, представитель русско-кабардинского рода. В 1646 году после возведения деревянной церкви во имя Николая Чудотворца село Собакино стало называться Никольское-Собакино. В 1667 году хозяином становится сын Якова Черкасского, князь Михаил.

В 1702 году Петром I велено было через Хлебниково от Москвы до Олонца проложить почтовую дорогу и поставить здесь 1-й Ям для смены лошадей в почтовых тройках.

После же смерти Михаила, Никольское в 1713 году по наследству досталось его сыну, князю Алексею Михайловичу Черкасскому.

В 1743 (1757?) году Хлебниково и ряд окрестных селений (Капустино, Шолохово, Новосильцево, Троицкое) перешли во владение графа Петра Борисовича Шереметева (1713-1788) в качестве приданного за Варвару Александровну Черскасскую. Во владении Шереметьевых они пробыли до 1917 года.

В 1767 году Хлебниково и Капустино были приписаны к селу Никольскому и состояли в Московском уезде Манатине-Быкове и Коровине стане, а в 80-е годы ХVIII века по новому административному делению вошли в Воскресенский уезд.

Село Никольское, а свою очередь, было приписано к селу Троицкому-Шереметьево. Деревня Хлебниково была соединена с Никольским, а также близлежащими Спасским-Павельцевым, Жаворонковым, и через реку Клязьма с селом Троицким проселочными дорогами. К востоку от Хлебниково находился Покровский погост. 

В середине XVIII века в Хлебниково имелось 48 дворов. В них проживало 160 крестьян. До закрытия часовни Николая Угодника они составляли основную массу ее прихожан, так как в селе Никольском крестьянских дворов не существовало. 

22 ноября 1777 года, при Петре Борисовиче Шереметеве, церковь Николая Чудотворца в Никольском-Собакине была упразднена по причине ветхости и неимения "довольного числа церковной утвари". 

То же самое произошло и с деревянной церковью во имя иконы Покрова Пресвятой Богородицы, расположенной на Покровском погосте, который находился восточнее деревни Хлебниково, через речку Еремку, впадающую в Клязьму. Покровская церковь после упразднения превратилась в кладбищенскую часовню и до наших дней не сохранилась. 

Прихожане стали посещать церковь Живоначальной Троицы в селе Троицком-Шереметьево. Каменная двухэтажная церковь была построена в 1704 году при князе М.Я. Черкасском, которому эта местность досталась в приданное за дочь Марфу от князя Я.Н. Одоевского, а впоследствии ставшая владением их внучки, в замужестве Шереметьевой.

Верхняя ее часть, посвященная Святой Троицы с приделами Преподобного Сергия (южный) и Покрова Пресвятой Богородицы (северный), не отапливалась. Третий, нижний придел св. Афанасия и Кирилла был теплым и принадлежал самому графу Петру Борисовичу Шереметьеву.

Первый исследователь Москвы и Московской провинции Г.Ф. Миллер, предпринявший в мае 1779 года поездку в Дмитров, пишет: "При хорошей погоде, которая уже несколько недель стояла и во время моего путешествия продолжалась, ... выехал я из Москвы 11-го майя в два часа после полудни на ямщицких подводах, кои в первой по дороге деревне Лихоборах крестьянскими лошадьми сменены были. Перед отъездом принужден я был заплатить в Московскую ямскую канцелярию вперед от Москвы до Лихобор за 12 верст прогонные деньги...

"Месяцеслов", изданный в Санкт-Петербурге в 1845 году пишет о прогонных деньгах, платимых по подорожным, на версту и лошадь: "В Российской Империи по три копейки серебром с версты. Между:...Москвою и станциями... Хлебниковой 24 версты".

Удобное географическое местоположение деревни Хлебниково вблизи Москвы на большом торговом тракте способствовало ее активному экономическому развитию и дальнейшему уплотнению застройки.

В начале XIX века Хлебниково значилось крупной владельческой деревней, расположенной в 24 верстах от Бутырской заставы на Дмитровском тракте. В 84-х ее дворах проживало уже 736 человек. При деревне работала почтовая станция. Планировка Хлебниково в 50-60-е годы XIX столетия сохраняла исторически сложившийся характер линейной двухсторонней застройки Дмитровского тракта. Параллельно руслу реки Клязьма появились новые строения, которые также представляли собой несколько линий домов к востоку и западу от тракта, с беспорядочно разбросанными между ними отдельными дворами. Плотность застройки постепенно увеличивалась. При этом более развитой оказалась западная часть деревни с густой сетью проселочных дорог по сравнению с восточной частью, лежащей на заболоченном берегу реки Клязьмы, русло которой круто петляло в этом месте.

После отмены крепостного права помещик граф Дмитрий Николаевич Шереметев, гофмейстер Императорского двора, предоставил своим временно-обязанным крестьянам Московского уезда Троицкой волости Хлебниковского сельского общества «деревню Хлебниково приобрести в собственность с усадебной их оседлостью поземельный надел».

В 1875 году в Хлебниково была открыта первая школа, которую построили крестьяне. Ее посещали местные дети и дети села Троицкого и деревни Капустино.

В 90-е годы XIX века административно Хлебниково находилось во 2-м стане Троицкой волости Московского уезда, куда входили и соседние села Павельцево, Котово, Виноградово и деревни Клязьма, Капустино и др.

Население Хлебниково составляло 744 человека. Здесь размещалась квартира урядника. На территории деревни находилось шерстопрядильное и ткацкое заведение Торгового дома М. М. Синицына с 87 рабочими, чуть позже открылся кирпичный завод Гаша.

Удобное географическое местоположение деревни Хлебниково вблизи Москвы на большом торговом тракте способствовало ее активному экономическому развитию и дальнейшему уплотнению застройки.

Примерно в это же время Дмитровский тракт шоссировали, на всем его протяжении установили новые заставы, где собирали пошлину за проезд по Дмитровке. Одна из них расположилась в Хлебниково. В Москву везли строительные материалы, топливо, изделия кустарного производства, пищевые продукты. Из столицы брали в основном бакалейные и галантерейные товары.

И хотя перед Октябрьской революцией Хлебниково оставалось еще довольно большим населенным пунктом (здесь работала шерстопрядильная фабрика с 87 работниками, существовал напилочный завод А. Г. Прейса с 48 рабочими, имелись трехклассное земское училище и больница при кирпичном заводе Гаша), с постройкой же железной дороги экономическое значение Дмитровского тракта и лежащей на нем деревни Хлебниково, удаленной от станции, значительно снизилось.

После революции обширная территория от Лихобор до Лобни вошли в состав Коммунистического района. Все лечебные учреждения были переданы в штат и подчинение райздравотдела района, в который входил и поселок Хлебниково. В 1939 году район был переименован в Краснополянский с центром в Долгопрудном.

Самая старинная улица в Хлебниково, на которой сохранился дом постройки XIX в - Московская. Она шла от поворота с Дмитровской дороги (до сих пор в 60-70 сантиметрах под водой сохранился ее "фундамент", что у шоссейного старого моста) параллельно реки Клязьма на запад (через Водники) и поворачивала у оврага в районе села Павельцево на Дмитров.

На углу Московской и Советской улиц сохранился кирпичный ныне двухэтажный дом богатых селян Грибовых. Как рассказывают старожилы, в этом доме была чайная, магазин, что обслуживал жителей Хлебниково.